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約翰霍普金斯全球疫情地圖開源 登上柳葉刀 華人博士出品

郭一璞 發自 凹非寺

量子位 報道 | 公眾號 QbitAI

一個多月前,當你被困在家裏無法出門的時候,可能每天早上第一件事就是看看疫情地圖,看看昨天又新增確診了多少。

現在,中國的疫情逐漸褪去,海外不少國家卻進入了水深火熱的狀態。

在約翰霍普金斯大學,兩位中國博士生和他們的導師一起,開發了一個可視化、可交互的全球疫情地圖。這個項目已經發在了《柳葉刀》上,目前在GitHub開源,獲得了超過4500顆星,也登上了GitHub熱榜。

約翰霍普金斯全球疫情地圖開源,登上柳葉刀,GitHub已有4500星

可視化地圖

整個可視化項目的界麵是這樣的:

約翰霍普金斯全球疫情地圖開源,登上柳葉刀,GitHub已有4500星

圖中的數據來自世衛組織,還有包括中國CDC、美國CDC、歐洲CDC在內的各個國家和地區的疾病控製部門,通過半自動的方式更新,而且,更新的比世衛組織還快:

約翰霍普金斯全球疫情地圖開源,登上柳葉刀,GitHub已有4500星

目前全球已經有超過11萬人感染。

中間的地圖部分可以隨意調整,也能直接切換選到不同的區域:

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大小不同的圓形表示該地確診人數多少:

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還可以選擇不同的底圖,符合不同用戶的看圖習慣,獲取更豐富的信息:

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比如切換成地形圖,你就會發現美國本土的疫情分布也和地理環境有關:

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你也可以分別查看整體病例數和排除治愈/病亡者的現有病例數地圖。

整體病例:

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現有病例:

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湖北的圈圈小了很多。

看到這裏你會注意到,隻有中國、美國、加拿大、澳大利亞的統計單位到了省/州一層,其他國家都是以國為單位統計的。

除了地圖,這個項目也可以看各國家和地區嚴重程度排行榜:

約翰霍普金斯全球疫情地圖開源,登上柳葉刀,GitHub已有4500星

目前最嚴重的,除了中國大陸,還有韓國、意大利、伊朗、法國、德國等國家。

還有病亡人數、治愈人數的數據:

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另外還有全球疫情增長圖:

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可以看到自從湖北全麵大排查後,中國大陸的患者數量基本上不太增長,而世界上的其他地方疫情擴散的速度依然不樂觀。

以上的每一個模塊都是可以展開的,查看起來非常清晰。另外,研究團隊也準備了移動版。

JHU中國博士生出品

這個項目來自約翰霍普金斯大學(JHU)係統科學與工程中心(CSSE),隸屬於JHU的土木工程係。

項目的作者有三位,是兩位中國博士生和他們的導師。

約翰霍普金斯全球疫情地圖開源,登上柳葉刀,GitHub已有4500星

一作董恩生,此前本科和碩士都是在愛達荷大學就讀的,目前研究網絡建模、空間可視化和傳染病。除了新冠肺炎,他還研究過美國和太平洋地區的麻疹和斯裏蘭卡的登革熱。

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二作Hongru Du,本碩分別就讀於愛丁堡大學和威斯康星大學麥迪遜分校。

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導師Lauren
Gardner,約翰霍普金斯大學土木工程係副教授,領導生物安全流動性跨學科研究——就是傳染病。另外她也曾在新南威爾士大學土木與環境工程學院任教,目前也是約翰霍普金斯大學彭博公共衛生學院傳染病動態組成員,以及澳大利亞聯邦科學與工業研究組織(CSIRO)的客座科學家。

傳送門

GitHub:

https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19

全球疫情地圖

https://www.arcgis.com/apps/opsdashboard/index.html#/bda7594740fd40299423467b48e9ecf6

柳葉刀論文


An interactive web-based dashboard to track COVID-19 in real
time

作者:Ensheng Dong, Hongru Du, Lauren Gardner

https://www.thelancet.com/journals/laninf/article/PIIS1473-3099(20)30120-1/fulltext

約翰霍普金斯2019-nCoV模型博客

https://systems.jhu.edu/research/public-health/ncov-model/

— 完 —

量子位 QbitAI · 頭條號簽約作者

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