作者項西行
如今新冠病毒的源頭問題已經成了一個和政治無法區分的難題。好在世界各地的不少科學家依然在孜孜以求地探索著事實和真相。近日，生物學的權威科學期刊《美國科學院院報》刊登了一篇來自英國劍橋大學的短文，對這個問題做出了迄今為止最為明確的回答。
但是，原文的重點是，通過推導病毒的進化過程來更好地指導隔離和防疫的戰略。所以他們沒有白字黑字地道出病毒發源的結論，經過解讀，總結如下：
所有證據指向新冠病毒發源於武漢；
尚無證據支持所謂的“美國起源說”。
至於微信中流行的說法“此文對全球華人是個幸事”，屬於聯想過度了。
我們在以前的文章曾對分子進化樹做過科普，不懂的讀者請複習。下麵的圖是對論文原圖的標注和解釋。在這個圖中，每個圓圈代表一種病毒基因序列的變化，圓圈的大小，和攜帶這種基因型的病人樣本的數量成正比。
根據基因構樹的原理，作者把截至到3月初的160份來自世界各地的病毒樣本分成三個大族：A，B和C。在這三個主族形成之前，來自蝙蝠的冠狀病毒經過一係列的突變（粗紅色箭頭），於2019年底進入人類，獲得人傳人的能力，在武漢的首批新冠病人樣本內檢出（細紅箭頭所指）。
然後，這首輪爆發的毒株，繼續在武漢突變，就形成了A族類的祖宗。1月21號，一位35歲的中國男人從武漢飛回西雅圖，就攜帶著這樣一枚A族類基因型，他成為美國本土的第一個確診病例，正所謂當武漢遇到西雅圖。
最近流行的微信中有“A類病毒在武漢隻有極少案例，而且多源於在武漢生活過的美國人”，是誤導的說法。論文中提到的“在武漢生活過的美國人”，其中一個就是這位華人。他在數據中的樣本號是，
BetaCoV/USA/WA1/2020。
一個半月之後，在西雅圖附近社區的一位確診病例，雖然和這個武漢人沒有交集，居然和他帶有一模一樣的突變，於是也被歸類在這個A族類內。這個現象，被西雅圖一位叫Trevor
Bedford的病毒學家發現，由此斷定新冠病毒已在當地西雅圖社區悄悄傳播了6個星期了，潛在的感染者可能已經數千。而在那個時候，高高在上的美國疾控中心(CDC)，還在做“新冠對美國威脅不大”的夢。
可貴的是，西雅圖學者的忠告被當地的官員及時聽取，他們早於美國任何一個地方加大了測試的力度，對病患的追蹤，以及抗疫物資的籌備。時至今日，作為美國第一個疫情爆發的地區，華盛頓州每日新增病例少於100，形勢顯然已經得到有效控製，和處於水深火熱的紐約、新澤西，形成了鮮明對照。
讓我們再回到病毒的傳播上，除了在武漢當地繼續擴增並傳至美國之外，A族類的毒株傳播比較廣泛，分布到了廣東，東亞和澳大利亞。不過A族係卻並非中國的肆虐中國乃至東亞的主要株係。
那麽是哪一個呢？是A家族繼續突變，形成的B家族毒株。
作者給出的科學推測是，可能A係本身不適應中國人的免疫係統，而從它突變後的毒株B具有更大的傳播效力。這個說法還有待探究和驗證。
有意思的是，這個B家族的原始基因型，基本在東亞國家轉悠而沒有進入歐美。這是由於美國和歐洲相繼對中國停航造成了隔絕效應嗎？值得研究。凡是進入西方國家的B家族成員，基本上都含有除了原始B突變以外的附加突變。
然後，B家族的繼續變化，形成了C家族，這個族係在在全部中國樣本中都缺失，卻是入侵歐洲的主力部隊，同時在港台和南韓也有發現。
同理，可能是歐洲人對B突變之後的C家族更加易感，因此C在歐洲長驅直入。
這篇文章的局限性在於，由於作者的投稿時間較早（三月初），病毒樣本還比較有限，其時美國的爆發尚未形成，難以對美國毒株的朔源進化做深入探討。
不過，這個缺憾已經得到了彌補。美國的學者幾天前對美東的病毒樣本進行了分子樹分析，結論是肆虐美東部特別是大紐約地區的毒株主要來自歐洲，而且已經是從一月開始就已經在社區中悄悄流行，很有可能比西雅圖確診的那位武漢人還要早。考慮到特朗普總統在3月11號才姍姍來遲地斷航歐洲，而且做壯士斷臂的悲壯樣，我們隻有嗬嗬兩聲，這早晚三秋了。
最後值得一提的是，這篇《美國科學院院報》的文章，基因朔源構樹的方法依據的是一個經典原則，叫“最大簡約法”，既在對現存數據有同等解釋能力的情況下，簡單直接了當的模型和進化樹更可能為真。所以，試圖東拉西扯把一潭水攪渾的腦洞大開式陰謀論者，應該從中學到點什麽了。
華客網：權威文獻直指Covid-19病毒的朔源和進化