位在新竹市清華大學校內的「清華海峽研究院」新竹辦公室疑違反兩岸條例，教育部今晚表示，已與經濟部、陸委會組成專案小組查察有關單位，發現該辦公室位在清大育成大樓5樓，由自強工業基金會向清大租賃，接著轉租廈門清華海峽研究院，並由該基金會代管空間，初步研判有違反兩岸條例第33條之1，將請該基金會主管機關經濟部進行裁罰，最高裁罰金額50萬元。
教育部指出，此辦公室還涉違反兩岸條例40條之2，教育部將與經濟部查證今天掌握到的事實，並請陸委會提供法律認定意見後，依法辦理裁罰。
教育部也說，將繼續請清大說明釐清此案涉及的產學合作、師生參與及辦公室產權使用情形。
教育部今天還同步發函各大專校院，指出兩岸教育交流目的是促進相互了解與溝通，應本著「平等互惠」原則，遵循兩岸條例、相關法規及現行政策，辦理各項教育交流活動。師生參與兩岸教育交流活動，及校內空間對外租賃或開放運用時，應符合兩岸條例第33條之1規定。
教育部提醒，各校若未經主管機關許可，不可以與有關中國大陸黨務、軍事、行政、具政治性機關及團體，或涉及對台政治工作、影響國家安全或利益的機關，從事任何形式的合作。
此外，教育部表示，各校不得與中國大陸人民、法人、團體或其他機構，聯合設立政治機構，或從事涉及政治性內容的合作行為。如有其他合作行為，也不得違反法令規定或涉有政治性內容。
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