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13組被刪除基因序列尋回 或助深挖新冠疫情源頭

布魯姆是在閱讀其他研究人員撰寫的一篇分析想要尋找那些基因序列時,才發現它們已從NIH的“序列閱讀檔案庫”被刪除的。發現此事後,布魯姆用了數天時間在互聯網上搜索,最終尋回了被刪除的部分序列。

綜合《華爾街日報》、《紐約時報》和《華盛頓郵報》報道,布魯姆在審查不同研究組織發表的資料時,發現了2020年3月的一份電子表格,其中包含241個武漢大學的科學家采集的新冠病毒基因序列,電子表格顯示,中國科學家將序列上傳到美國政府的國家醫學圖書館的“序列閱讀檔案庫”,但當他在本月較早尋找這些序列時,結果卻是“無法找到”。

他在不解之下返回電子圖表尋找更多線索,發現241個序列是被武漢人民醫院一位名叫傅艾思(Aisi
Fu,音譯)的科學家采集的,通過搜索醫療文獻,布魯姆最終找到2020年3月傅艾思和同事在網上貼出的另一項研究,講述檢測新冠病毒的一個新方法,他們3個月後在一家科學期刊上發表這一成果。

論文中寫到,他們研究了疫情早期從疑似感染病毒的門診病人那裏獲得的鼻咽拭子病毒樣本,尋找可能的新冠病毒基因物質。他們沒有公布他們在那些樣本中實際獲得的基因序列,但一些線索讓布魯姆意識到,這些樣本就是被刪除的241個基因序列。

布魯姆經過搜索,發現這些序列很多儲存在穀歌雲端平台,並從那裏尋回了13個序列。

獲得這些序列後,布魯姆將它們和更早從華南海鮮市場獲得的樣本進行比較,發現從海鮮市場的病毒樣本增加了3個變異,但在後來采集的樣本中卻沒有這種變異,這似乎支持了新冠病毒沒有經過海鮮市場的觀點,暗示新冠病毒在海鮮市場出現前,已經在武漢或其他地區傳播了一段時間的看法。

布魯姆說,從之前排序得知的武漢早期出現的情況可能有偏差。布魯姆承認他的這個結論還需對病毒序列做進一步的分析。

亞利桑那大學進化生物學家沃羅貝(Michael
Worobey)表示,布魯姆的論文是傑出的調查報告,將會極大推進對新冠病毒起源的了解。沃羅貝目前正和同事對新冠病毒基因開展一項大規模研究,以便更好地了解病毒起源,他們將會把布魯姆找回的13個序列加入研究中。

華客新聞 | 時事與歷史:13組被刪除基因序列尋回 或助深挖新冠疫情源頭